譬如索额图在制定太子仪制的时候，授意太子的衣物一律使用黄色，将其规格几乎抬高到和皇帝等同的地位。每年三大节，太子在主敬殿接受百官朝贺，行二跪六叩礼。康熙发现索额图的所作所为之后，特意把他叫来，不满地说：“太子所用的仪仗等物，太为过制，与朕所用相同”。康熙的意思是说，太子是太子，皇帝是皇帝，两者是有本质区别的……他似乎也隐隐感觉到了一种潜在的威胁。
康熙对索额图的不满，也可以说是由来已久的。康熙三十五年（公元1696年）的时候，索额图随同康熙亲征噶尔丹，当时康熙亲率中路军，大将费扬古、孙思克则率西路军，两路分进，后来由于西路军被风雪所阻，未能和中路军如期会师，导致中路军有所突前。当时噶尔丹散布谣言说马上有六万俄罗斯兵前来增援，索额图一向畏缩怕死，立马就听信了，加上西路军没有按约会合，他一慌张便力请康熙回銮，让中路军先脱身再说。最后，西路军孤军迎战，所幸在费扬古、孙思克的率领下，西路军在昭莫多和噶尔丹血战一场，结果噶尔丹惨败，仅以身免。
康熙为索额图的退兵之议感到十分的羞耻和屈辱，当时激愤得泪流满面，说：“朕一意前进，以剿灭噶尔丹为念。不知索额图等视朕为何如人也！今朕失约即返，则西路之兵不可问矣！”
索额图懦弱怕死已经不是第一次了，早在吴三桂叛乱之时，他就因为临敌怯懦、畏手畏脚而遭到康熙的申斥。越是关键时候，索额图就越是如此，这一次也不例外。索额图被痛斥后，觉得没脸见人，回来后便向康熙提出致仕（退休）。但是，索额图虽然屡误大事，但偏死不认错，被罢官后对康熙多有怨言，自己又不甘寂寞。他勾结了一些党徒，趋奉在太子胤礽的门下，企图东山再起。
再说这时的太子因为熏染恶习，康熙屡加警告后依旧冥顽不灵，这时也有失宠的危险，于是索额图和胤礽就更加抱团在一起，经常潜谋国事，发泄自己的怨恨。康熙四十一年（公元1702年），康熙带着胤礽等皇子南巡走到德州的时候，胤礽突生急病，康熙为了让胤礽复原更快，特意把已被罢免的索额图召来负责看护事宜。因为胤礽生病，康熙一行人在德州耽误了十多天，后来康熙便取消了这次南巡，半道返回了京师。但胤礽的病情并未完全好转，于是康熙便命索额图继续留在德州照顾太子，直到康复。
索额图和胤礽在德州的一个多月里，两人肆意妄为，索额图乘马直达太子住所中门才下（论法当是死罪），但胤礽却不以为然。胤礽在德州所用之物都是黄色，其他的仪注也都仿造皇帝，种种不法之事，后来都被人告发，康熙得知后十分震怒，终于在康熙四十二年（公元1703年）以“议论国事，结党妄行”的罪名将索额图交宗人府拘禁。
康熙在拘禁索额图的上谕中说，“尔任大学士时，因贪恶革退，后朕复起用，尔并不思念朕恩。即若养犬，尚知主恩，若尔者，极力加恩亦属无益。朕欲差人到尔家搜看，但被尔牵连之人甚多，举国俱不得安，所以中止。朕若不先发，尔必先之，朕亦熟思之矣。朕将尔行事指出一端，就可在此正法。”
这段话颇多玄机。所谓“若不先发，尔必先之”，这应该指的是索额图与太子胤礽篡谋大位之事，只不过说得隐讳而已。而前面还说了一句，“被尔牵连之人甚多，举国俱不得安”，这说明“太子党”人数众多，要不早做处理的话，恐怕后患无穷。
由此，康熙便采取了断然措施，将索额图和家人全部圈禁，其同党额库礼等人也加以拘禁，这些人的子孙，凡在朝中任职的全部革退。康熙还特别警告那些负责拘禁的官员和侍卫们说，“若尔等在索额图处行走，必将被索额图连累致死”，以防止这些人和索额图勾结，为他通风报信。由此可见，索额图的耳目甚多，能量相当大，康熙不得不早做提防。
索额图被拘禁后，“人们依旧怕他”。当时大部分人之所以不敢出来揭发他，怕的就是康熙如果不将他处死，万一哪天太子登基的话，到时候索额图出来会大加报复。在这种情况下，康熙便决心将索额图处死。索额图在五月十九日被拘禁，在七月初便死于禁所。
索额图的死是必然的。作为皇帝，最不能容忍的就是别人威胁到他的皇权，因为这往往意味着威胁到他的生命。万一索额图潜谋篡位成功，不但康熙的老命不保，而且太子也可能受制于他，康熙对此是决不会坐视不理的。当年汉武帝想立弗陵（汉昭帝）为太子，当时考虑到“主小母壮”，加之汉朝有母后外戚擅权的传统，便心一狠，将弗陵的母亲钩弋夫人给处死了。汉武帝后来还洋洋得意地说，这是为了儿子继位后扫除母后干政的危害。
但凡遇到这种事情，皇帝都不会手软。不过，就当时而言，索额图即使有这个想法，也未必真敢去发动政变。当然，索额图一旦有了这样的念头，康熙必然会置他于死地。怪不得索额图死了多年之后，康熙还恨恨不已，骂索额图乃“本朝第一罪人也”。
康熙大概忘了，当年索额图帮助他消灭鳌拜势力的时候，也是他称索额图是“本朝第一功臣”的。帝王翻手为云，覆手为雨，所谓伴君如伴虎，诚哉斯言！
索额图因“潜谋大事”而被处死，对“太子党”是个极为沉重的打击，对于太子胤礽来说也是个极为不祥的信号，只不过拘于太子地位，康熙在上谕中没有明说罢了。索额图事件使得康熙和太子的矛盾暴露无遗，胤礽的地位也就岌岌可危了。如此说来，太子的结果会怎样呢？
补记：二月河在《雍正皇帝》中说明珠是胤?的舅舅，后来以此改编的几个电视剧也这样演，这个玩笑开大了。事实上，惠妃与明珠是叶赫纳喇家族、贝勒金台石的后裔，金台石生二子，长子为德尔格勒，次子尼雅哈（也作倪迓韩）。惠妃的父亲索尔和是德尔格勒的次子，明珠是尼雅哈的次子，明珠和惠妃的父亲索尔和是堂兄弟关系，惠妃是明珠的堂侄女，由此，胤?和明珠差了两代。这在《清皇室四谱》和《八旗满洲氏族通谱》可以查到。有意思的是，在冯尔康先生的《雍正传》中也认为明珠是惠妃的哥哥，他标的来源是《永宪录》，似乎有误。