据修昔底德记载，那些侥幸渡过最后劫难活下来的人，其境况多半也是极其悲惨的。由于这种疾病从头部发起，进而传遍身体各部位，所以一个人纵或幸免于死，其四肢也都留有它的痕迹。“这种疾病蔓延至生殖器、手指和脚趾，许多人丧失了这些器官的功能，有些人还丧失了视力。还有一些人，在他们开始康复的时候，完全丧失了记忆力，他们不知道自己是谁，也不认识自己的朋友了”。
尽管修昔底德无法给后人留下这次瘟疫所造成的具体死亡人数，但通过他的描述，我们仍能深刻地体会到当时可怕的情形。他还写道：“瘟疫的凶险似乎连动物都有所彻悟，它们惟恐避之不及。虽然许多死者的尸体裸露在地上无人掩埋，但食人肉的鸟兽不是不接近尸体，就是撕咬了尸体的肉后因此而死亡……这类鸟实际上已经绝迹了；在尸体附近或其他地方，已经看不到这种鸟了”。这种瘟疫的威力是如此巨大的，以致同人类朝夕相伴的狗和其他家畜都无法幸免。
瘟疫的凶险似乎连动物都有所彻悟，它们惟恐避之不及。
当瘟疫发展到高峰时，雅典死亡的人数是如此之多，以至于人们已没有足够的时间和精力来掩埋死者了。“城里各个区都设了焚烧点，尤其是那些挤满了难民的地方，甚至连那些神圣的区域也不例外。人们把死尸扔进焚烧炉里，有时因为尸体压着尸体，很多都没有焚烧完全。为了给焚烧点提供足够的木料，甚至专门组成了一些小队。有的焚烧炉彻夜不息，阴森可怖的浓烟和臭不可闻的气味遮住了城市的上空，熏黑了崭新的建筑上洁白的大理石”。